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AI 摘要

本文系统阐述了肿瘤基因检测中样本采集的核心知识与操作规范。文章首先介绍了组织、外周血和细胞学标本三大样本类型,并明确了组织样本为金标准的优先选择顺序。随后详细解释了蜡块、白片、病理切片等不同样本形态的区别与用途。针对临床常见问题,文章提供了不同肿瘤患者细胞学标本的选择建议、多病灶送检策略、PD-L1检测的样本要求,并重点分析了组织和血液样本质控不合格的常见原因。最后,文章规范了血液样本的采集、保存与运输流程,并强调了ctDNA检测的适宜采血时机及相关注意事项。

  • 肿瘤基因检测优先选择组织样本,其次为细胞学标本,最后是血液,组织是检测的金标准。
  • 详细区分了蜡块、蜡卷、白片、防脱白片和病理切片等不同样本形态的定义及临床检测用途。
  • 指出样本质控关键,组织不合格主因是样本量不足、核酸降解或无肿瘤细胞;血液不合格主因是溶血、高血脂或采血不足。
  • 规范了血液样本采集流程,强调ctDNA检测需根据治疗状态选择合适采血时间,如术后至少2周或耐药进展时。
这篇文章讨论了哪些主题?

肿瘤基因检测,样本采集,组织标本,液体活检,ctDNA,PD-L1检测,样本质控,二代测序,安龙基因,临床共识

文章核心观点是什么?

导语肿瘤基因检测,顾名思义,就是针对与肿瘤相关的基因进行检测的一门技术,常用基因检测技术有:一代测序(Sanger)、实时聚合酶链反应(PCR)、荧光原位杂交(FISH)、免疫组化(IHC)及二代测序(NGS)等方法。不管是采用何种基因检测技术,整个流程第一步都是样本采集,随之而来的问题就是选择哪种类型的样本,如何采集、保存及运输样本,才能保证检测结果的可靠性。因此,小编整理了肿瘤基因送检过程中的

数据来源:原文链接

小龙科普|肿瘤基因检测样本采集篇

发布时间:2024-05-20 阅读量:28

肿瘤基因检测,顾名思义,就是针对与肿瘤相关的基因进行检测的一门技术,常用基因检测技术有:一代测序(Sanger)、实时聚合酶链反应(PCR)、荧光原位杂交(FISH)、免疫组化(IHC)及二代测序(NGS)等方法。不管是采用何种基因检测技术,整个流程第一步都是样本采集,随之而来的问题就是选择哪种类型的样本,如何采集、保存及运输样本,才能保证检测结果的可靠性。因此,小编整理了肿瘤基因送检过程中的常见问题,供大家参考!

Q1

肿瘤基因检测可以送检哪些样本

类型?

肿瘤基因检测常见三大样本类型:组织、外周血和细胞学标本(胸腔积液/心包积液/腹水/脑脊液)。

《晚期乳腺癌基因检测热点问题中国专家共识(2021版)》推荐:晚期乳腺癌患者基因检测,优先选择对新鲜组织进行检测,如组织不可及可考虑石蜡包埋组织切片、血浆、胸腹水等。

Q2

针对不同类型样本应该如何选择?

样本选择顺序:组织样本>细胞学标本(胸腹水/脑脊液等)>血液。

组织标本是肿瘤基因检测样本的“金标准”,在《非小细胞肺癌融合基因检测临床实践中国专家共识(2023版)》指出:推荐首选肿瘤组织学标本进行融合基因检测,无法获取足够肿瘤组织学标本时,可选择细胞学标本;无法获取足够肿瘤组织学或细胞学标本时,建议选择液体活检(血液、浆膜腔积液、脑脊液等的上清液)作为补充检测手段。

Q3

如何分清蜡块、蜡卷、白片、防脱

白片和病理切片?

蜡块:将切下来的组织送到病理科后进行一系列包括取材,固定,脱水,包埋制作成的大小约为2x2cm的蜡块。组织可以是手术样本、穿刺或气管镜等活检样本、胸腹水、心包积液等细胞学样本。

蜡卷:使用切片机把蜡膜切下来直接装在EP管中,这些无需贴在载玻片上且呈卷状的蜡膜即蜡卷,蜡卷通常无法进行质控评估,需随寄一份病理切片进行评估

白片:是指未经染色的石蜡组织切片。把蜡块用切片机切成一张薄薄的蜡膜(通常是4µm),再贴附在载玻片/涂胶载玻片上就制成了白片。白片可用于制作常规病理分析的HE切片、免疫组化(IHC)切片及行基因检测等病理检查。

防脱白片:带正电荷(+)的防脱载玻片制成的白片,为了防止像IHC(如PD-L1蛋白表达检测)或FISH(如HER2基因扩增检测)等实验过程中贴在载玻片上的组织发生脱落。

病理切片:通常所说的病理切片是HE切片,HE切片是将白片进行苏木精-伊红染色后制成的,经过HE染色,细胞核呈蓝色,细胞质呈红色,方便病理科医生进行形态学的观察。

Q4

不同的肿瘤患者细胞学标本如何

选择?

细胞学标本在检测基因突变方面具有较高的可靠性和有效性。在胸腔积液沉渣中病理分析检出肿瘤细胞的前提下,优先使用胸腔积液进行液体活检。不同类型肿瘤患者在不同类型细胞学标本选择上也有区别,胸水检测适合肺癌患者,腹水检测适合消化系统肿瘤等患者,脑脊液检测适合脑转移(尤其是脑膜转移)以及胶质瘤患者【3-9】。


《肺癌CSCO指南(2023)》提到:对于恶性胸腔积液或心包积液等细胞学样本在细胞数量充足条件下可制备细胞学样本蜡块,进行基因变异检测。考虑到细胞学样本的细胞数量少等特点,细胞学标本的检测结果解释需格外谨慎。

《二代测序技术在NSCLC中的临床应用中国专家共识》指出:胸腔积液ctDNA体现出比血液ctDNA更好的检测性能,在条件允许的情况下,在胸腔积液沉渣中病理分析检出肿瘤细胞的前提下,优先使用胸腔积液进行液体活检。

Q5

来源于不同部位的两个组织,应该

如何送检?

首先确定两个病灶是否为同一来源还是多处来源:①如果确定原发灶和转移灶,肺癌以及结直肠癌CSCO诊疗指南提出原发灶和转移灶均适于靶向驱动基因检测,实验室推荐初诊患者送检原发灶,治疗之后出现复发进展患者,推荐送检转移灶。②确定多原发病灶的话,能满足实验室的检测标准的样本都是可以送检的,具体送检的组织建议以医生评估最具有代表性的样本,但是仅对送检样本的检测结果负责。

Q6

PD-L1检测可送检哪些标本类型?

什么时候检测?

目前PD-L1免疫组化的检测标本一般为组织学样本和部分细胞学样本(如胸水、腹水等),22C3检测系统要求HE染色切片中至少存在100个活肿瘤细胞。优先石蜡包埋标本肿瘤组织防脱切片(需要5张),手术切除标本和活检标本均可进行PD-L1检测,支持使用细胞学包埋蜡块,不推荐使用细胞涂片和骨转移脱钙标本,不可以使用蜡卷,建议优先选择近期标本检测,尽量避免使用>3年的标本应用于PD-L1检测。共识建议患者初诊时及时更换治疗方案前,样本来自原发灶以及转移灶均可进行PD-L1检测。

Q7

组织样本质控不合格的原因有哪些?

组织样本质控不合格的原因主要包括:送检组织样本过小,抽提总量不满足后续检测需求;送检组织保存时间超过1年以上或固定、包埋、保存过程出现问题,导至核酸降解严重,不满足后续检测需求;送检组织通过HE染色阅片,未发现肿瘤细胞,无法进行后续检测。以下是日常组织样本(包含胸腹水)送检不规范及防范措施:

Q8

外周血样本质控不合格的原因有

哪些?

外周血样本质控不合格的原因主要包括:溶血、高血脂、采血不足。具体如下

①溶血的原因包括:采血人员操作(比如标本未及时摇匀或剧烈晃动);样本运输不当(比如保存温度过高或过低);化疗后取血。

②高血脂的原因包括:抽血时未空腹或空腹时间不足;不良生活方式;长时间高胆固醇、高脂肪酸及高热量摄入;高血压、心血管疾病、糖尿病、肥胖症、肾脏疾病等继发而引起的高血脂症。

③采血不足的原因包括:抗凝剂EDTA的量相对增加,可诱导血小板聚集使得检测结果偏低,也可使得红、白细胞等形态发生改变,影响检验结果。

Q9

外周血采集中,游离DNA管和EDTA

凝管如何选择?

游离DNA管和EDTA抗凝管均可用于血液样本采集,但根据检测项目不同而有所区别,EDTA抗凝管主要用于检测胚系突变评估遗传风险,游离DNA管主要用于检测体系突变评估精准用药以及预后等。

Q10

ctDNA检测的血液样本在什么时候

采集

ctDNA检测的血液取样时间根据检测项目以及患者状态(分期,治疗等因素)有所区别:①以根治性手术/放疗后进行MRD动态监测为目的ctDNA分析,建议早期患者根治性术后至少2周以及晚期根治性手术/放疗后达到完全缓解,后续MRD监测为每3-6个月。②以精准用药或预后评估为目的的ctDNA分析,对于取不到组织的III-IV期患者,在没经受任何治疗前或治疗后临床确认耐药进展或复发采集ctDNA样本最合适。假如已经放化疗,放化疗结束两周后再采血做检测。

另外,《液体活检在临床肿瘤诊疗应用和医学检验实践中的专家共识》指出:在液体活检分析前质量管理中,需关注患者状态,标本采集时的患者状态将影响检测结果,如基础状态、治疗方案、肿瘤转移情况,因此选择适当的采集时间点极为重要。确保患者在标本采集前两周前未进行化疗或放疗,以避免假阴性的结果;对存在严重炎症的肿瘤患者,建议在白细胞恢复正常水平后再行检测,以避免假阴性结果;推荐早晨空腹采取静脉血,以防止油脂影响DNA提取和检测。

Q11

输血或移植后多久可以做基因检测?

输血前或输血后隔3个月或取其他组织细胞做基因检测;进行过骨髓移植者不能用外周血样进行分子生物学检测;其他器官移植者影响较小,最好采集口腔粘膜或尿液脱落上皮细胞代替外周血进行基因检测。

Q12

如何规范的采集、保存及运输血液

样本保证样本的合格性?

按静脉血采集操作要求,采集3-5mL或8-10mL全血样本分别于EDTA管、游离DNA管中,采血后请立即轻柔颠倒10次,以保证血液与抗凝剂充分混匀。采集完成后,尽量在48小时内进行血浆分离;最晚不超过72小时。如需运输,使用采血管保护材料将采血管包装好,在常温或4℃运输至实验室检测。以下日常血液样本送检不规范及防范措施:

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